联系我们 scanpy和Seurat单细胞分析对比
2024-09-28scanpy和seurat分析代码相比 尝试把曾憨厚的单细胞seurat分析的代码诊疗成scanpy版块的,包括样品读取,质控,harmony去除批次效应,降维聚类,marker坚贞。 seurat版块的R代码 先望望seurat版块的R代码,内部调用了另外几个文献,lib.R,qc.R,harmony.R,check-all-markers.R,这几个文献曩昔应该齐有共享过.scRNA_scripts文献夹的r代码齐在上头的百度云网盘一语气(https://pan.baidu.com/s/1M
管理系统开发价格 irGSEA:基于秩次的单细胞基因集富集分析整合框架
2024-09-28管理系统开发价格 距离上一次先容irGSEA,仍是是两年前了,详见:8种要领可视化你的单细胞基因集打分,当今Seurat齐仍是更新到了V5,假如你不心爱最新版的Seurat包的单细胞理念,赶巧这个irGSEA亦然与时俱进,不单是是更新到了17种基因汇集打分算法,何况是合营V4和V5版块的Seurat责任流,相配的便捷!要是大家看完毕这个万字长文的先容,仍然是陶然潜入了解irGSEA不错望望文末的交流群哈! 布景 许多Functional Class Scoring (FCS)要领,如GSEA,